Елена Николаевна ведет большую научную работу, имеет более 300 публикаций в научных журналах, в том числе и за рубежом, 6 монографий (в соавторстве с академиками РАН И.И. Дедовым, Л.В. Адамян) и более 20 глав в монографиях, большое количество научно-практических и методических пособий, проводит обучение аспирантов, клинических ординаторов и врачей на рабочих местах. Индекс Хирша в настоящее время составляет 15. Под ее руководством защищены четыре кандидатские диссертации, продолжается работа еще над тремя.

Андреева Е.Н. является признанным Международным экспертом в области эндокринной гинекологии, эндометриоза. В 2014-2015 гг. принимала деятельное участие в Международном научно-обучающем проекте. Участвует с докладами в работе российских и международных конгрессов и семинаров. В 2001 г. организовала и в течение 15 лет успешно проводит научно-практические конференции (школы) по актуальным вопросам эндокринной гинекологии на базе ФГБУ ЭНЦ МЗ РФ, читает лекции практическим врачам, пользуется большим авторитетом коллег.

Елена Николаевна – заместитель главного редактора журнала «Вестник репродуктивного здоровья», член редакционного совета журналов «Проблемы репродукции», «Ожирение и метаболизм», «Доктор.ру».

В течение нескольких лет член диссертационного и ученого совета ФГБУ «Эндокринологический научный центр» Минздрава России.