А.Д. Каприн известен своими фундаментальными работами в области онкоурологии и онкорадиологии. Им разработан комплекс методических подходов, связанных с хирургическим лечением различных онкологических заболеваний, создано современное научное направление в области обоснования и создания новых высокоэффективных методик лечения рака мочевого пузыря, оценены возможности органосохраняющего лечения пациентов. Впервые в стране им внедрена в практику высокомощностная брахитерапия источниками иридия-192.

А.Д. Каприн уделяет значительное внимание разработке и внедрению новейших радиологических методов диагностики при онкологических заболеваниях; осуществляет научное руководство разработкой основных направлений научных исследований, нацеленных на создание эффективных методов диагностики и лечения злокачественных опухолей, проведение экспериментальных исследований, организацию онкологической помощи.

Основные направления научных исследований А.Д. Каприна

- получение новых данных в области медицинской радиологии, общей и прикладной радиобиологии, радиационной медицины и эпидемиологии;

- разработка новых методов лучевого и комбинированного лечения злокачественных новообразований;

- создание на основе выполненных исследований рациональной лечебно-реабилитационной и диагностической системы обследования пациентов с онкологическими заболеваниями;

- оптимизация оказания больным высокотехнологической медицинской помощи;

- создание ракового регистра федерального уровня.

Автор более 700 печатных научных работ. Главный редактор журналов «Исследования и практика в медицине» и «Онкология. Журнал им. П.А. Герцена». Член редакционной коллегии журнала «Онкоурология», журнала «Вестник урологии», журнала «Радиация и риск» (Бюллетень Национального радиационно-эпидемиологического регистра), член редакционного совета журнала «Экспериментальная и клиническая урология».

Отличник здравоохранения (2006)

Заслуженный врач Российской Федерации (2007)

Награжден медалью «В память 850-летия Москвы», Орденом почета (2015).